Styl Ishizuke to imitacja krajobrazu złożonego z drzewa, skały oraz ewentualnie innych roślin.
W ramach tego stylu wyróżniamy dwa podstyle:
Bonsai umiejscowione na skale
Drzewo położone na skale, ale jego korzenie wplecione są w skałę i sięgają doniczki, czerpiąc stamtąd składniki pokarmowe
Bonsai posadzone na skale
Drzewko jest faktycznie posadzone na skale, a jego korzenie nie mają kontaktu z doniczką.